Որո՞նք են բջիջ ներթափանցող պեպտիդները:

Բջիջ ներթափանցող պեպտիդները փոքր պեպտիդներ են, որոնք հեշտությամբ կարող են թափանցել բջջային թաղանթ:Մոլեկուլների այս դասը, հատկապես թիրախային գործառույթներով CPP-ները, խոստանում են թիրախային բջիջներին դեղերի արդյունավետ առաքում:

Ուստի դրա վերաբերյալ հետազոտությունն ունի որոշակի կենսաբժշկական նշանակություն։Այս հետազոտության ընթացքում տարբեր տրանսմեմբրանային ակտիվությամբ CPP-ները ուսումնասիրվել են հաջորդականության մակարդակում՝ փորձելով պարզել CPP-ների տրանսմեմբրանային ակտիվության վրա ազդող գործոնները, տարբեր ակտիվությամբ CPP-ների և NonCPP-ների միջև հաջորդականության տարբերությունները և ներկայացնել կենսաբանական հաջորդականությունների վերլուծության մեթոդ:

CPP-ների և NonCPP-ների հաջորդականությունները ստացվել են CPPsite տվյալների բազայից և տարբեր գրականություններից, և բարձր, միջին և ցածր տրանսմեմբրանային ակտիվությամբ տրանսմեմբրանային պեպտիդներ (HCPPs, MCPPs, LCPPs) դուրս են բերվել CPP-ների հաջորդականություններից՝ տվյալների հավաքածուներ կառուցելու համար:Այս տվյալների հավաքածուների հիման վրա իրականացվել են հետևյալ ուսումնասիրությունները.

1, Տարբեր ակտիվ CPP-ների և NonCPP-ների ամինաթթուների և երկրորդային կառուցվածքի կազմը վերլուծվել է ANOVA-ով:Պարզվել է, որ ամինաթթուների էլեկտրաստատիկ և հիդրոֆոբ փոխազդեցությունները կարևոր դեր են խաղացել CPP-ների տրանսմեմբրանային ակտիվության մեջ, իսկ պարուրաձև կառուցվածքը և պատահական ոլորումը նույնպես ազդել են CPP-ների տրանսմեմբրանային ակտիվության վրա:

2. Երկչափ հարթության վրա ցուցադրվել են տարբեր ակտիվությամբ CPP-ների ֆիզիկական և քիմիական հատկությունները և երկարությունները:Պարզվել է, որ տարբեր ակտիվությամբ CPP-ները և NonCPP-ները կարող են խմբավորվել որոշ հատուկ հատկությունների ներքո, և HCPP-ները, MCPP-ները, LCPP-ները և NonCPP-ները բաժանվել են երեք կլաստերների՝ ցույց տալով դրանց տարբերությունները.

3. Այս աշխատության մեջ ներկայացվում է կենսաբանական հաջորդականության ֆիզիկական և քիմիական ցենտրոիդ հասկացությունը, և հաջորդականությունը կազմող մնացորդները դիտվում են որպես մասնիկների կետեր, իսկ հաջորդականությունը վերացվում է որպես հետազոտության համար նախատեսված մասնիկների համակարգ:Այս մեթոդը կիրառվել է CPP-ների վերլուծության համար՝ տարբեր գործողություններով CPP-ներ նախագծելով 3D հարթության վրա PCA մեթոդով, և պարզվել է, որ CPP-ների մեծ մասը հավաքվել են միասին, իսկ որոշ LCPP-ներ՝ կլաստերավորված NonCPP-ների հետ միասին:

Այս ուսումնասիրությունը հետևանքներ ունի CPP-ների նախագծման և տարբեր գործողություններով CPP-ների հաջորդականության տարբերությունների ըմբռնման համար:Բացի այդ, այս հոդվածում ներկայացված կենսաբանական հաջորդականությունների ֆիզիկական և քիմիական ցենտրոիդների վերլուծության մեթոդը կարող է օգտագործվել նաև այլ կենսաբանական խնդիրների վերլուծության համար:Միևնույն ժամանակ, դրանք կարող են օգտագործվել որպես կենսաբանական դասակարգման որոշ խնդիրների մուտքային պարամետրեր և դեր խաղալ օրինաչափությունների ճանաչման գործում: